這間廟位於南丫島的索罟灣上，從這間廟的建造，可以看出南丫島一些奇特之點。

南丫島是一個小小的海島，為甚麼要建兩間天后廟呢？

原來南丫島的島形，像一株樹的樹椏，這丫叉分界的地方，即是丫頸的部分，就成為中界線，北面的稱北約，南面的稱南約，數千年前已用這自然環境來劃分。北面的海灣就是榕樹灣，故屬於北南丫島的居民。自建天后廟於榕樹灣，南面的居民，也自建天后廟於南邊的索罟灣上。

南丫島有人住已證實有數千年，因為考古家不斷在島上掘出很多新石器時代的遺物，數年前又在蘆鬚城附近發現唐朝的灰庵遺址，證明自古該島居民分南北二區居住。

這間天后廟建於何時已不可考究，相信已有二百年之久，目前可見的古物，是廟內有一個聚寶爐，爐上鑄有「道光六年吉旦」六字；道光六年即一八二六年，距今已逾百多年了。 另一較古的東西，是廟內的一座古鐘，這古鐘是光緒乙末年所鑄，距今已近百年。

廟內的碑記，亦說明不知創建於何代，但碑記也說出此廟的沿革，一共重修了三次。第一次在光緒三十三年重修，即一九０七年；第二重修於民國廿一年，即一九三二年；最近一次重修，是一九六二年。

現時香港的廟宇。由華人廟宇委員會所管理，因此廟貌永遠保持常新，主要原因是每隔一年就例要髹一次。